Was ist ein microarray?

Gefragt von: Benno Friedrich  |  Letzte Aktualisierung: 1. Januar 2022
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Microarray ist eine Sammelbezeichnung für moderne molekularbiologische Untersuchungssysteme, die die parallele Analyse von mehreren tausend Einzelnachweisen in einer geringen Menge biologischen Probenmaterials erlauben.

Wie funktioniert ein Microarray?

Auf dem DNA-Microarray sind sämtliche Gene des zu untersuchenden Organismus auf einer Glasplatte, dem „Gen-Chip“, als einsträngige DNA angeordnet (englisch array = Anordnung). Die erzeugte cDNA wird auf den DNA-Chip gegeben und die cDNA-Sequenzen binden (hybridisieren) an ihren komplementären Gegenpart auf dem Array.

Was versteht man unter DNA Chip?

Die DNA-Chip-Technologie (synonym DNA-Microarray) ist eine biochemische und bioinformatische Methode zur Bestimmung von Mengen unterschiedlicher DNA. Sie ist eine Variante des Microarrays (synonym Chip) mit DNA. Microarrays dienen vor allem der Bestimmung relativer Änderungen der Genexpression.

Wie funktioniert ein genchip?

Bei einer Genchip-Analyse werden eine bestimmte Menge genau definierter, ein- strängiger DNS-Sequenzen – die DNS- Sonden – mit einer Trägermatrix – dem Chip – fest verbunden. Die unterschied- lichen DNS-Sonden für die jeweilige Gensequenz, auf welche man testen will, sind rasterförmig auf dem Chip angeord- net.

Welche Information liefert die Helligkeit bei genchips?

Die DNA-Fragmente werden auf den Genchip gegeben und binden an die Sonden, die ihrer eigenen Sequenz entsprechen. Computer und Laser sorgen für die Auswertung: Leuchtet ein bestimmter Fleck auf dem Genchip hell auf, wissen die Forscher, dass diese Genvariante in dem untersuchten Erbgut vorkommt.

Gene Expression Analysis and DNA Microarray Assays

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Was versteht man unter Epigenetik?

Der Begriff "Epigenetik" ist zusammengesetzt aus den Wörtern Genetik und Epigenese, also der Entwicklung eines Lebewesens. Epigenetik gilt als das Bindeglied zwischen Umwelteinflüssen und Genen: Sie bestimmt mit, unter welchen Umständen welches Gen angeschaltet wird und wann es wieder stumm wird.

Wie funktioniert eine Genomanalyse?

Für die Untersuchung selbst reicht dann eine Blut- oder Speichelprobe aus: Wir isolieren die DNA, reichern die gewünschten Abschnitte an und entschlüsseln das Erbgut. Auch die Datenanalyse und die Befundung erfolgen bei uns.

Was macht die gensonde?

Gensonden sind Poly- oder Oligonukleotide (meistens einsträngige DNA, seltener RNA), die eine komplementäre Basensequenz zum gesuchten Gen aufweisen und sich an die passende DNA-Sequenz einer (immobilisierten) DNA anlagern können.

Wie wird eine gensonde hergestellt?

DNA-Sonden werden durch Phosphoramidit-Synthese, Random Priming, Polymerase-Kettenreaktion (PCR), Nick translation, Tailing oder Phosphorylierung erzeugt. RNA-Sonden, auch Ribosonden (engl. riboprobe) genannt, werden durch In-vitro-Transkription hergestellt.

Wie wird cDNA hergestellt?

cDNA ist eine DNA, die mittels des Enzyms Reverse Transkriptase (RT) aus RNA synthetisiert wird. Mit Hilfe des Enzyms Reverse Transkriptase kann aus RNA die dazu komplementäre cDNA hergestellt werden.

Wie funktioniert Hochdurchsatzsequenzierung?

Die Hochdurchsatz-Sequenzierung (Next Generation Sequencing, NGS) ermöglicht die parallele Sequen- zierung von mehreren DNA-Abschnitten in einem Durchgang. Die Methode wurde in den letzten Jahren erfolgreich zur umfassenden Charakterisierung von Tumorgenomen eingesetzt.

Welche Arten von Gentechnik gibt es?

Gentechnik
  • Grüne Gentechnik – Agrogentechnik – Anwendung bei Pflanzen.
  • Rote Gentechnik – Anwendung in der Medizin und Pharmazeutik.
  • Weiße Gentechnik – Anwendung in der Industrie.
  • Graue Gentechnik – Anwendungen speziell in der Abfallwirtschaft.

Wie funktioniert Fish?

Bei der Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH) wird die Sonde mit Hilfe eines fluoreszierenden Farbstoffes nachgewiesen. Dies ermöglicht den gleichzeitigen Nachweis mehrerer Strukturen durch den Einsatz verschiedener Fluoreszenzfarbstoffe, zum Beispiel den Nachweis eines Chromosoms mit zwei darauf liegenden Genen.

Warum Reverse Transkription?

Die Reverse Transkription wird vor allem von Retroviren genutzt. Bei Retroviren besteht das Genom aus RNA, welches zunächst in die DNA umgeschrieben werden muss, bevor es transkribiert und translatiert werden kann. ... In Eukaryoten wird die Reverse Transkription genutzt, um die Telomere zu verlängern.

Was ist eine RNA Sequenz?

Als RNA-Sequenzierung wird die Bestimmung der Nukleotidabfolge der RNA bezeichnet. Hierfür wird die RNA in cDNA übersetzt, damit die Methode der DNA-Sequenzierung angewendet werden kann. RNA-Seq enthüllt Informationen zur Genexpression, wie zum Beispiel unterschiedliche Allele eines Gens exprimiert sind.

Wie gelangt die genetische Information vom Zellkern zu den Ribosomen?

Im Rahmen der Proteinbiosynthese muss der genetische Code deshalb aus dem Zellkern zu den Ribosomen (Ort der Proteinbiosynthese) gebracht werden. Dies geschieht über die sogenannte mRNA (messenger-RNA), die eine komplementäre Kopie eines Teilstücks der DNA repräsentiert.

Wie macht man einen genetischen Fingerabdruck?

Beim genetischen Fingerabdruck wird die DNS zunächst zerlegt. Dies geschieht mit Enzymen, einer Art chemischer Schere. Dabei entstehen unterschiedlich lange Bruchstücke. Sie lassen sich nach ihrer Größe auftrennen und mit Hilfe von radioaktiven Sonden sichtbar machen.

Wie schneiden restriktionsenzyme?

Restriktionsenzyme, auch Restriktions-Endonukleasen, erkennen spezifische DNA Sequenzen und schneiden die DNA dann direkt an der Erkennungsstelle oder in einem definierten Abstand (siehe auch Typen von Restriktionsenzymen).

Was ist die Hybridisierung?

hybridisation) bezeichnet einen für molekulargenetische Techniken bedeutsamen Vorgang, bei dem sich an einem Einzelstrang einer DNA (z. B. Southern Blot) oder einer RNA (z. ... RNA-Einzelstrang anlagert, indem Wasserstoffbrückenbindungen zwischen den jeweils komplementären Nukleinbasen ausgebildet werden.

Was sind markermoleküle?

In der biologischen Diagnostik werden so genannte Markermoleküle benutzt, die wiederum an bestimmte Stoffe in einer Probe oder im Körper des Patienten binden und diese dadurch nachweisbar machen. Unter anderem lassen sich so Krebszellen aufspüren.

Was versteht man unter Gentransfer?

Als Gentransfer bezeichnet man die Übertragung von einem oder mehreren Genen in eine Empfängerzelle. In der Molekularbiologie ist ein Vektor ein Transportvehikel, um eine DNA-Sequenz in eine Empfängerzelle einzubringen. Als Vektoren werden häufig Plasmide verwendet.

Was passiert in der Proteinbiosynthese?

Die Proteinbiosynthese stellt einen der zentralsten Prozesse im menschlichen Körper dar. Einfach gesagt, werden durch die Proteinbiosynthese neue Proteine in Zellen gebildet. Das Synthetisieren neuer Proteine geschieht nach einem durch die genetischen Informationen festgelegtem Plan.

Was bedeutet Genomanalyse?

Genomanalyse, Verfahren der Analyse des Erbguts, die beim Menschen insbesondere zur Feststellung von Erbanlagen (Gen) für Merkmale, Krankheiten (Erbkrankheiten, Tab.)

Wie viel kostet eine Genomanalyse?

In den USA kann jeder Fragen wie diese per Gentest klären. Experten warnen jedoch vor diesen Analysen, die in Deutschland ohnhein verboten sind. Stuttgart - Der vermeintliche Blick in die Zukunft kostet 199 US-Dollar (umgerechnet 169 Euro).

Was ist eine Trio EXOM Analyse?

Die Analyse des Fötus sowie beider Elternteile (Trio-Exom-Diagnostik) ermöglicht daher die effizienteste Evaluation und erhöht die Wahrscheinlichkeit krankheitsverursachende Varianten zu identifizieren. Von 500 Analysen konnten wir durch diese Methode bei 36% die krankheitsverursachende Veränderung identifizieren.